孩子看手机时间长头疼可能是长期保持一个姿势、睡眠不足、精神过度集中、视疲劳、营养不良等因素引起的，可以在医生的指导下通过日常调理、药物治疗的方式治疗。具体分析如下：

1.长期保持一个姿势：长时间保持同一姿势时，特别是低头看手机，可能会导致颈部肌肉紧张，引起血液循环不畅，从而引发头疼，建议控制看手机的时间，并且定期调整姿势。

2.睡眠不足：如果孩子长期睡眠时间不足，或者睡眠质量低下，在长时间使用手机后，可能会使大脑和身体处于疲劳状态，容易引发头疼。建议及时调整孩子的作息，保证其拥有充足的睡眠。

3.精神过度集中：使用手机时，特别是进行复杂的视觉和认知任务时，容易导致大脑长时间集中注意力，从而增加头疼的风险。建议家长控制孩子看手机的时间，有助于改善该情况。

4.视疲劳：长时间盯着屏幕看，可能导致眼睛肌肉过度紧张，造成眼睛不适，从而出现眼干、眼痛、头疼等症状。家长需要在医生的建议下给孩子使用萘敏维滴眼液、玻璃酸钠滴眼液等药物进行治疗。

5.营养不良：如果孩子存在挑食、偏食等行为，容易导致身体营养摄入不足，从而诱发该疾病。长时间看手机后，可能会出现头疼、头晕等不适症状。家长可以遵医嘱给孩子使用酪酸梭菌活菌散、阿胶口服液等药物缓解不适。

如果孩子出现身体不适，建议家长及时带其前往医院进行检查，明确病因后进行针对性治疗。